Dra. Sonia Dávila Ramos |
Profesor InvestigadorLaboratorio de Biología Estructural Categoría: Titular A – SNI: Nivel I Formación académica.
Email: sonia.davila@uaem.mx Tel: +52 (777)3297000 ext. 3276 / +52 (777) 3297020 Cuerpo Académico. |
Publicaciones originales recientes
1. Quispe-Ricalde MA, Castelán-Sánchez HG, Meza-Rodríguez PM, Dávila-Ramos S, Sierra JL, Batista-Garcia R, Concha-Velasco F, Lucana SF, De Santa Cruz J, Zea V, Galarza M, Caceres-Rey O, Tsukayama P, Foronda P, Soto-Chambi BJ, Abreu N. Evidence of natural selection and dominance of SARS-CoV-2 variant Lambda (C.37) over variants of concern in Cusco, Peru. Arch Virol. 2023 Feb 14;168(3):88. doi: 10.1007/s00705-022-05645-x. PMID: 36786950; PMCID: PMC9926449.
2. Tenorio-Salgado S, Castelán-Sánchez HG, Dávila-Ramos S, Huerta-Saquero A, Rodríguez-Morales S, Merino-Pérez E, Roa de la Fuente LF, Solis-Pereira SE, Pérez-Rueda E, Lizama-Uc G. 2021. Metagenomic analysis and antimicrobial activity of two fermented milk kefir samples. Microbiologyopen. 10(2):e1183.
3. Peidro-Guzmán H, Pérez-Llano Y, González-Abradelo D, Fernández-López MG, Dávila-Ramos S, Aranda E, Hernández DRO, García AO, Lira-Ruan V, Pliego OR, Santana MA, Schnabel D, Jiménez-Gómez I, Mouriño-Pérez RR, Aréchiga-Carvajal ET, Del Rayo Sánchez-Carbente M, Folch-Mallol JL, Sánchez-Reyes A, Vaidyanathan VK, Cabana H, Gunde-Cimerman N, Batista-García RA. 2020. Transcriptomic analysis of polyaromatic hydrocarbon degradation by the halophilic fungus Aspergillus sydowii at hypersaline conditions. Environ Microbiol.
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4. Villacís JE, Reyes JA, Castelán-Sánchez HG, Dávila-Ramos S, Lazo MA, Wali A, Bodero LA, Toapanta Y, Naranjo C, Montero L, Campos J, Galas MG, Gestal MC. 2020. OXA-48 carbapenemase in Klebsiella pneumoniae sequence type 307 in Ecuador. Microorganisms, 8(3), 435.
5. Castelán-Sánchez, Hugo G.; Meza-Rodríguez, Pablo M.; Carrillo, Erika; Ríos-Vázquez, David I.; Liñan-Torres, Arturo; Batista-García, Ramón A.; Pérez-Rueda, Ernesto; Rojas-Ruíz, Norma E.; Dávila-Ramos, Sonia. 2020. The microbial composition in circumneutral thermal springs from chignahuapan, puebla, mexico reveals the presence of particular sulfur-oxidizing bacterial and viral communities. Microorganisms.
6. Gómez-Silva, B.; Vilo-Muñoz, C.; Galetović, A.; Dong, Q.; Castelán-Sánchez, H.G.; Pérez-Llano, Y.; Sánchez-Carbente, M.R.; Dávila-Ramos, S.; Cortés-López, N.G.; Martínez-Ávila, L.; Dobson, A.D.W.; Batista-García, R.A. 2019. Metagenomics of Atacama Lithobiontic Extremophile Life Unveils Highlights on Fungal Communities, Biogeochemical Cycles and Carbohydrate-Active Enzymes. Microorganisms. 7, 619.
7. Castelán-Sánchez HG, Elorrieta P, Romoacca P, Liñan-Torres A, Sierra JL, Vera I, Batista-García RA, Tenorio-Salgado S, Lizama-Uc G, Pérez-Rueda E, Quispe-Ricalde MA, Dávila-Ramos S. 2019. Intermediate-Salinity Systems at High Altitudes in the Peruvian Andes Unveil a High Diversity and Abundance of Bacteria and Viruses. Genes (Basel). 10(11). pii: E891.
8. Dávila-Ramos Sonia, Castelán-Sánchez Hugo G., Martínez-Ávila Liliana, Sánchez-Carbente María del Rayo, Peralta Raúl, Hernández-Mendoza Armando, Dobson Alan D.W., González Ramón A., Pastor Nina, Batista-García Ramón Alberto. 2019. A Review on Viral Metagenomics in Extreme Environments. Frontiers in Microbiology. 10:2403.
9. Castelán Sánchez Hugo G., López-Rosas Itzel, García-Suastegui Wendy A., Peralta Raúl, Dobson Alan D.W., Batista-García Ramón Alberto, Dávila-Ramos Sonia. Extremophile deep-sea viral communities from hydrothermal vents: Structural and functional analysis. Volume 46, Pages 16-28. 2019.
10. Mamani J. Ilucion, Pacheco Kevin B., Elorrieta Paola, Romoacca Pedro, Castelan Hugo, Davila Sonia, Sierra Jose L., Quispe-Ricalde Maria A. 2019. Draft Genome Sequence of Halomonas elongata MH25661 Isolated from a Saline Creek in the Andes of Peru. Microbiol Resour Announc. Jan; 8(1): e00934-18.
11. Peralta Raul, Garcia Paola, Valdivia Alejandra, Lopez Arianna, Apresa Teresa, Hernandez Dulce M., Gallegos Francisco, Alvarado-Cabrero Isabel, Vargas-De-Leon Cruz, Davila Sonia, Romero Pablo, Salcedo Mauricio. 2018. HPV Could be a Potential Factor of Survival in Laryngeal Cancer: a Preliminary Study in Mexican Patients. Asian Pac J Cancer Prev; 19(6): 1711–1716.
12. Medina-Aparicio Liliana, Dávila Sonia, Rebollar-Flores Javier E., Calva Edmundo, Hernández-Lucas Ismael. 2018. The CRISPR-Cas system in Enterobacteriaceae. Pathog Dis. Feb 1;76(1).
13. Sonia Dávila-Ramos, Alejandro Estradas-Romero, Rosa María Prol-Ledesma, Katy Juárez-López. 2015. Bacterial populations (first record) at two shallow hydrothermal vents of the Mexican Pacific west coast. Geomicrobiology Journal.
14. Pastor Nina, Dávila Sonia, Pérez-Rueda Ernesto, Segovia Lorenzo, Martínez –Anaya Claudia. 2014. Electrostatic analysis of bacterial expansins. Proteins; 83:215–223.
Proyectos actuales
1. Metagenómica viral en ventilas hidrotermales del Golfo de California con fines biotecnológicos.
2. Metagenómica viral comparativa entre pacientes con IRAs y personas sanas.
3. Obtención de Arbovirus de distintas poblaciones de mosquitos en México.
Artículos de divulgación y difusión
1. ####
Dirección de tesis recientes
Licenciatura:
1. Cintia Beatriz Pérez López. Estudio integral ómico de los mecanismos de defensa en Solanum lycopersicum durante la infección por Begomovirus. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. 2022.
2. María Guadalupe Ayala Rodríguez. Metagenómica viral de ambientes extremos e identificación de sus posibles hospederos mediante CRISPR CAS. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. 2022.
3. Frida Gómez Jaimes. Análisis comparativo de la comunidad de virus y su interacción con la microbiota intestinal de Apis mellifera en distintos períodos estacionales. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. 2022.
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4. Luis Donaldo Ramírez Corona. Comparación in silico de la diversidad y evolución del viroma de los mosquitos vectores Aedes aegypti y Culex pipiens. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. 2022.
5. Karen Lilibeth Díaz André. Análisis de metagenómica viral a partir de muestras de pacientes con IRAs (Infecciones Respiratorias agudas) y personas sanas en Morelos. Licenciatura en Ciencias (Bioquímica y Biología Molecular), UAEM. Mayo 2017.
6. Fernando R. Pérez Villatoro. Análisis metagenómico de sedimentos de la cuenca Wagner y Consag en el Golfo de California. Licenciado en Ciencias Genómicas. Enero 2016.
Doctorado:
1. M. en C. Lysell Ruiz de León. Análisis fisiológico y molecular de Exophiala dermatitidis crecido en presencia de dopamina y 1,2,4- bencenotriol. Doctorado en Ciencias, IICBA-UAEM. En proceso.
2. M. en Microbiol. Majela García Montero. Patogenicidad de levaduras aisladas de glaciares. Doctorado en Ciencias, IICBA-UAEM. En proceso.
3. Hugo Gildardo Castelán Sánchez. Estudio comparativo metagenómico viral de ambientes acuáticos extremos. Doctorado en Ciencias, IICBA-UAEM. 2021..
Capítulos de libro
1. Hernández-Eligio José Alberto; Soto Lizeth; Andrade Ángel; Olvera Leticia; Dávila Sonia; Morett Enrique; Juárez López Katy. 2014. Chapter 12.4. CARACTERIZACIÓN DEL SISTEMA DE DOS COMPONENTES PilS/PilR Y SU MECANISMO DE REGULACIÓN SOBRE EL GEN pilA EN Geobacter sulfurreducens. In: Poggi-Varaldo, H.M.; Bretón-Deval, L.M.; Camacho-Pérez, B.; Escamilla-Alvarado, C.; Escobedo-Acuña, G.; Hernández-Flores, G.; Muñoz-Páez, K.M.; Romero-Cedillo, L.; Sastre-Conde, I.; Macarie, H.; Solorza-Feria, O.; Ríos-Leal, E.; Esparza-García, F. (Editors): Environmental Biotechnology and Engineering -2014, Volume 3, pages 1278-1288. Ed. Cinvestav, Mexico D.F., Mexico.
2. E. Morett, K. Juarez, S. Davila, L. Olvera, S. Caro and H. Flores. 1998. Enhancing Nitrogen Fixation Gene Expression by Modifying the DNA-binding function of Rhizobium meliloti NifA. En Elmerich, C., Kondorosi, A. & Newton , W. (eds). Biological Nitrogen Fixation for the 21st Century. Kluwer Academic Publishers. Netherlands pp 728, ISBN: 978-0-7923-4834-4.
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