Dr. Gamaliel López Leal

Profesor Investigador

Laboratorio de Biología Computacional y Virómica Integrativa (BCVI).

Categoría: Asociado C – SNI: Nivel I

Formación académica:

  • Doctorado en Ciencias. Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México. 2014.
  • Posdoctorado. Max Planck Tandem Group in Computational Biology, Universidad de los Andes. 2021.

Email: gamaliel.lopez@docentes.uaem.edu.mx

Tel: +52 (777)3297020

Cuerpo Académico: Regulación de la expresión genética

Publicaciones originales recientes

1. Arellano-Maciel D, Hurtado-Ramírez JM, Camelo-Valera LC, Castillo-Ramírez S, Reyes A, López-Leal G*. «Geographic variation in abundance and diversity of Acinetobacter baumannii Vieuvirus bacteriophages». Frontiers in Microbiology. (2025). doi:10.3389/fmicb.2025.1522711.

2. Segundo-Arizmendi N, Arellano-Maciel D, Rivera-Ramírez A, Piña-González AM, López-Leal G*, Hernández-Baltazar E. «Bacteriophages: A Challenge for Antimicrobial Therapy». (2025). doi.org/10.3390/microorganisms13010100

Ver más publicaciones

3. Hidalgo P, Torres A, Jean Beltran PM, López-Leal G, Bertzbach LD, Dobner T, Flint SJ, Cristea IM, González RA. «The protein composition of human adenovirus replication compartments». (2024). doi.org/10.1128/mbio.02144-24.

4. Loyola-Cruz MÁ, Durán-Manuel EM, Cruz-Cruz C, Bravata-Alcántara JC, Gutierrez-Muñoz V, Márquez-Valdelamar LM, Leal-Escobar B, Vásquez-Jiménez E, Cureño-Díaz MA, Lugo-Zamudio GE, Calzada-Mendoza CC, López-Leal G, Castro-Escarpulli G, Rojas-Bernabé A, Fernández-Sánchez V, Plascencia-Nieto ES, Nieto-Velázquez NG, Bello-López JM. «Imported malaria cases by Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax in Mexican territory: potential impact of the migration crisis». Travel Med Infect Dis. (2024). doi:10.1016/j.tmaid.2024.102773.

5. Tenorio-Carnalla K, Aguilar-Vera A, Hernández-Alvarez AJ, López-Leal G, Mateo-Estrada V, Santamaria RI, Castillo-Ramírez S. «Host population structure and species resolution reveal prophage transmission dynamics». mBio (2024). doi.org/10.1128/mbio.02377-24.

6. Piña-González AM, Castelán-Sánchez HG, Hurtado-Ramírez JM, López-Leal G*. «Campylobacter prophage diversity reveals pervasive recombination between prophages from different Campylobacter species». Microbiology Spectrum (2023) doi: 10.1128/spectrum.02795-23.

7. Gómez-Sánchez I, Castelán-Sánchez HG, Martínez-Castilla LP, Hurtado-Ramírez JM, López-Leal G*. «Genetic insights into the microevolutionary dynamics and early introductions of human monkeypox virus in Mexico». Archives of Virology (2023). doi: 10.1007/s00705-023-05936-x.

8. Castelán-Sánchez HG, Martínez-Castilla LP, Sganzerla-Martinez G, Torres-Flores J, López-Leal G. «Genome evolution and early introductions of the SARS-CoV-2 Omicron Variant 2 in Mexico». Virus Evolution (2022). doi: 10.1093/ve/veac109.

9. López-Leal G*, Camelo-Valera LC, Hurtado-Ramírez JM, Verleyen J, Castillo-Ramírez S, Reyes-Muñoz A. «Mining of Thousands of Prokaryotic Genomes Reveals High Abundance of Prophages with a Strictly Narrow Host Range». mSystems (2022). doi: 10.1128/msystems.00326-22.

10. Andrade-Martínez JS, Camelo Valera LC, Chica Cárdenas LA, Forero-Junco L, López-Leal G, Moreno-Gallego JL, Rangel-Pineros G, Reyes A. «Computational Tools for the Analysis of Uncultivated Phage Genomes». Microbiology and Molecular Biology Reviews (2022). doi.org/10.1128/mmbr.00004-21.

11. Arrieta O, Molina-Romero C, Cornejo-Granados F, Marquina-Castillo B, Avilés-Salas A, López-Leal G, Cardona AF, Ortega-Gómez A, Orozco-Morales M, Ochoa-Leyva A, Hernandez-Pando R. «Clinical and pathological characteristics associated with the presence of the IS6110 Mycobacterium tuberculosis transposon in neoplastic cells from non-small cell lung cancer patients». Scientific Reports (2022) doi: 10.1038/s41598-022-05749-z.

Proyectos actuales

1. Análisis de la evolución y diversidad de los profagos y sus hospederos mediante herramientas computacionales.

2. Caracterización y análisis genómico de bacteriófagos con potencial terapéutico contra bacterias multidrogo resistentes. .

Artículos de divulgación y difusión

1. Castelán-Sánchez HG., López-Leal G., Martínez -Castilla LP., Torres-Flores J. 2022. Decodificando la Diversidad del SARS-CoV-2. Ciencias y Humanidades, CONACyT.

Dirección de tesis recientes

Licenciatura:

1. Dafne Arellano Maciel. Análisis de la historia evolutiva del género Vieuvirus en A. baumannii. Universidad Abierta y a Distancia de México. México, 2023.

2. Edgar Bernardo Equihua Medina. Identificación y genómica comparativa de bacteriófagos temperados en el viroma de niños sanos, obesos y niños obesos con complicaciones metabólicas. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 2018.

Capítulos de libro

1.

Líneas de Investigación.
Caracterización de viromas y genomas virales: nos enfocamos en el estudio de la diversidad, composición funcional y dinámica evolutiva de comunidades virales presentes en distintos ambientes y hospedadores.
Filogenómica de fagos y profagos. Caracterización de las poblaciones de profagos en patógenos clínicamente relevantes. Buscamos entender las interacciones fago-hospedero, así como los procesos de “domesticación” de los fagos.

Laboratorio de Biología Computacional y Virómica Integrativa (BCVI).
El Laboratorio de Biología Computacional y Virómica Integrativa está dedicado al estudio de virus y bacterias desde una perspectiva genómica y evolutiva. Combinamos herramientas de bioinformática, metagenómica y filogenómica para caracterizar comunidades virales (viromas), analizar la diversidad y evolución de profagos, y comprender su papel en la resistencia antimicrobiana y la dinámica de los genomas bacterianos

Integrantes:
⊛ Adán Manuel Piña González
⊛ Danna Paola Bours Lugo